儿童再生障碍性贫血可以通过支持疗法、雄激素疗法、骨髓移植的方法治疗。

儿童再生障碍性贫血是由多种原因引起的骨髓造血功能衰竭的一组综合病征，一般表现为贫血、出血、感染、发热，并伴有走路乏力、头晕等症状。

支持疗法包括预防感染、避免出血、纠正贫血、保护肝脏、杜绝接触各类危险因素、正确护理等。具体方法包括输血、使用抗生素如氯霉素等。 

雄激素如甲睾酮为治疗慢性儿童再生障碍性贫血首选药物，这是因为雄激素对造血干细胞具有直接刺激作用，促使其增殖和分化。但是使用雄激素会出现痤疮、毛发增多、声音变粗、儿童骨成熟加速及骨骺早期融合，且有一定程度的水钠潴留的副作用。

骨髓移植是治疗干细胞缺陷引起儿童再生障碍性贫血的最佳方法，且能达到根治的目的。一旦确诊严重型或极严重型儿童再生障碍性贫血，有HLA配型相符供者，在有条件的医院应首选异基因骨髓移植，移植后长期无病存活率可达60%～80%，但移植需尽早进行。