牙齿根部的肉有点疼可能是外伤、根尖周炎、智齿冠周炎等原因造成，需要积极治疗。

1、外伤：

如果患者牙齿根部受到了磕伤或砸伤，就有可能会损伤局部的软组织以及神经，从而出现疼痛的感觉，可以通过48小时内冰敷以及48小时后热敷的方式进行缓解，一般情况下不需要进行特殊治疗。

2、根尖周炎：

根尖周炎是发生在根尖周围组织的炎症性病变，局部组织长期受到炎症刺激，从而会出现疼痛、脓肿等多种症状，而根尖也位于牙齿根部，所以会出现局部疼痛，由于根尖周炎并没有特效药物，所以需要通过根管治疗术、根尖诱导成形术、根尖外科手术等方式治疗。

3、智齿冠周炎：

智齿冠周炎是指智齿在萌出过程中萌出不全以及阻生时发生的一种化脓性炎症，因为局部很容易会嵌塞食物并且滋生细菌，从而会出现疼痛、肿胀、糜烂等多种症状，可以在医生的指导下服用布洛芬缓释胶囊、头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行缓解，如果情况比较严重，还需要进行脓肿切开引流术、龈瓣切除术等方式改善。

除了以上原因以外，还有可能是牙髓炎等因素引起，但不管是哪种原因，都需要及时就医，意外延误最佳治疗时间，影响病情的恢复。