尿道和肛门中间的地方有小疙瘩可能是外痔、肛周湿疹、生殖器疱疹等原因导致的，患者需遵医嘱应用药物或手术进行治疗。

一、外痔：

外痔是位于齿状线以下肛周皮肤和皮下结缔组织炎性增生、静脉扩张或血栓淤滞而形成的肿块，患有外痔时就可出现尿道和肛门中间的地方有小疙瘩的情况，还可出现肛门不适、潮湿不洁、瘙痒、疼痛等症状。患者可以采取局部热敷或者坐浴的方法来减轻疼痛，疼痛严重者可口服止痛药物进行治疗，如对乙酰氨基酚、布洛芬、洛索洛芬钠等，也可行血栓外痔剥离术等手术治疗。

二、肛周湿疹：

肛周湿疹是指发生于肛门周围皮肤的一种变态反应性皮肤病，患者可出现明显的瘙痒，不同程度的红斑、水疱等症状。病变多局限于肛门口及其周围皮肤，但也有累及臀部、会阴及阴囊等处，此时就可出现尿道和肛门中间的地方有小疙瘩的情况。患者应在医生的指导下应用药物进行治疗，如外用氧化锌软膏、丁酸氢化可的松乳膏等，也可口服抗组胺类药物，如氯雷他定、西替利嗪等。

三、生殖器疱疹：

生殖器疱疹是一种常见的性传播疾病，由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起，患有本病时就可出现尿道和肛门中间的地方有小疙瘩的情况。可遵医嘱应用药物进行治疗，如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等。

除以上常见原因外，还有其他疾病的可能性，比如肛乳头肥大，患者可遵医嘱应用高锰酸钾温水坐浴，对于症状严重的肛乳头肥大还可行肛乳头切除术治疗。