如果说是由厌氧菌感染引起来的结肠炎症，可以应用甲硝唑，导致结肠炎的病因比较复杂，有遗传因素、免疫因素以及其他的感染，比如其他的细菌、真菌的感染，这种情况用甲硝唑基本上没有什么效果，甲硝唑着用于治疗肠道和肠外阿米巴病，也可用于治疗阴道滴虫病。
一般情况下主要是用于肠道阿米巴病以及假滴虫病，该药物在应用过程当中有可能会出现不良反应，其中比较常见的就是消化道反应，包括恶心、呕吐、食欲不振，这就是有可能导致神经精神方面的症状，头痛、眩晕、感觉异常，肢体麻木，共济失调，多发性神经炎，大剂量有可能会引起抽搐，也有可能会导致过敏，出现皮肤发红、瘙痒、皮疹、荨麻疹这样的改变。如果对该药物过敏禁止使用，孕妇以及哺乳期妇女要避免使用，再就是小孩儿尽量的避免使用。
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