丙肝不会影响艾滋病窗口期，丙肝是指感染丙型肝炎病毒而引起的传染病，而艾滋病是指感染人类免疫缺陷病毒引起的传染病。
丙肝病毒主要侵犯肝细胞，而艾滋病毒主要侵犯CD4t淋巴细胞，两者作用的原理是不同的。
丙肝的抗体也会在感染丙型病毒肝炎后产生，艾滋病的抗体是感染人类免疫缺陷病毒后产生。艾滋病毒的抗体最早可以在感染后十天产生，最晚也在感染后的三个月内产生。
艾滋病毒的窗口期是指初次感染艾滋病，艾滋病毒抗体尚未形成的这一段时期，丙型肝炎病毒并不会对艾滋病毒的抗体产生影响，因此丙肝不会影响艾滋病窗口期。
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