肛瘘形成原因一般有以下两种原因：
一，婴儿肛周脓肿，反复破溃闭合破溃，这样反反复复，肛门隐窝与肛门皮肤纤维组织增生形成窦道，在体表的肛脓肿直肠内相通，这就形成了肛瘘。
二，肛门腺体异常成脓状扩张，并有分泌功能，尤其是男性新生儿，一过性雄性激素分泌过多，容易继发感染，反复发作形成肛瘘，前者比较多见。
一般肛瘘早期可以选择内科治疗方法，扩大外口引流，每日，温水坐浴热敷，全身应用抗菌药，保持排便通畅，一部分病例可获得痊愈，如果反复发作就需要手术进行治疗。
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